【R】都道府県別　がん死亡者数

総務省統計局が発表している都道府県別の主要死因別死亡者数（平成24年）のうち悪性新生物（がん）による死亡者数を第六十四回日本統計年鑑（平成27年）から取得し、地図上にプロットしてみます 。

library(leaflet)
library(knitr)
library(kableExtra)
library(dplyr)
library(tidyr)
library(stringr)

dat <- read.csv("http://www.dinov.tokyo/Data/JP_Pref/Pref_data.csv", header = TRUE, fileEncoding="UTF-8")
col_start <- 0.2
col_end <- 0.0

table_df<-data.frame(都道府県=dat$都道府県, がん死亡者数=dat$悪性新生物死因)
datc_m <- cut(dat$悪性新生物死因, hist(dat$悪性新生物死因, plot=FALSE)$breaks, right=FALSE)
datc_mcol <- rainbow(length(levels(datc_m)), start = col_start, end=col_end)[as.integer(datc_m)]

windowsFonts(JP4=windowsFont("Biz Gothic"))
windows(width=800, height=800)
par(family="JP4")

library(NipponMap)
JapanPrefMap(datc_mcol, main="がん死亡者数 （平成24年）　　(総務省統計局より) ")
legend("bottomright", fill=rainbow(length(levels(datc_m)), start = col_start, end=col_end), legend=names(table(datc_m)))

library(clipr)
kable(table_df, align = "c") %>%
  kable_styling(full_width = F) %>%
  column_spec(1, bold = T) %>%
  collapse_rows(columns = 1, valign = "middle") %>%
  write_clip

人口が多い都道府県はやはり多いのですが、今度は人口比で比べてみたいですね。