【R】gtsummary

1. はじめに

こちらでは、gtの使い方をみましたが、その後で”【R】データ要約ガチ勢のためのgtsummaryで表を書こう”なる記事を発見し、ちょっと見てみました。

2. インストール

CRANからできます。

install.packages("gtsummary")

3. つかってみる

まず、簡単に。

library(tidyverse)
library(gtsummary)

data("diamonds")

diamonds %>% tbl_summary()

すごい、ちゃんとsummaryができてる。

diamonds %>% 
  select(carat, cut, depth, table, price) %>% 
  tbl_summary(
    by = cut,
    statistic = list(all_continuous() ~ "{mean} ({sd})")
  )

なんと、検定もしてくれます。

diamonds %>% 
  select(carat, cut, depth, table, price) %>% 
  tbl_summary(by = cut) %>% 
  add_p() %>% 
  bold_p() %>% 
  add_n()

さらに、回帰まで！

diamonds %>% lm(price ~ carat + depth + table, data = .) %>% 
  tbl_regression(intercept = TRUE)

4. さいごに

まさに至れり尽くせりのパッケージです。

また、”【1-11-2】医療統計で必要なtable1、集計からofficeに貼り付けるまでをgtsummaryパッケージで一気に行う”のページも大変参考になります。