【R】tidyheatmaps

1. はじめに

こちらでtidyなheatmapを描くtidyHeatmapというパッケージを紹介しました。今回も同じくtidyなheatmapを描くパッケージtidyheatmapsの紹介です。こちらな、とってもパワフルなpheatmap by @raivokolde.へのインターフェースとして開発したようです。複雑なheatmapを最低限のコードで描けるように組数されています。

2. インストール

Githubからインストールします。

devtools::install_github("jbengler/tidyheatmaps")

3. 使ってみる。

library(tidyheatmaps)
library(tidyverse)

mtcars_tidy <- 
  mtcars %>% 
  as_tibble(rownames="Car name") %>% 
  mutate_at(vars(-`Car name`, -hp, -vs), scale) %>%
  pivot_longer(cols = -c(`Car name`, hp, vs), names_to = "Property", values_to = "Value")

mtcars_tidy

tidy_heatmap(mtcars_tidy,
             rows = `Car name`,
             columns = Property,
             values = Value,
             scale = "row",
)

4. さいごに

もっと色々複雑な描画ができるようですが、今日はここまでです。