【R】rgbif

1. はじめに

フリーでオープンな生物多様性データベースにGBIFというのがあります。このデータの取得を容易にしてくれるパッケージがrgbifです。

2. インストール

CRANからインストールできます。

install.packages("rgbif")

3. つかってみる

データの取得はこんな感じに。

library(tidyverse)
library(rgbif)

gbif_data <- occ_data(scientificName = "Equisetum arvense", hasCoordinate = TRUE, limit = 100)

leafletで地図に表示してみます。

library("leaflet")

gbif_data %>% 
  leaflet(width = "100%", height = "400px") %>%
  addTiles() %>% 
  addMarkers(lat=gbif_data$data$decimalLatitude, lng=gbif_data$data$decimalLongitude)

4. さいごに

非常に多くのデータがあるので、上手く活用できると良いですね。